RF（高周波）とマイクロ波プラズマの主な違いは、波長と被処理物へのエネルギーの伝達方法に関連しています。
RFプラズマは約13.56MHzの周波数で作動し、マイクロ波プラズマは約2.45GHzの周波数で作動する。この周波数の違いにより、それぞれのプラズマの特性や用途が異なる。
マイクロ波プラズマは、GHz帯の高電磁放射を特徴とする。ダイヤモンド、カーボンナノチューブ、グラフェンなどの炭素材料の合成によく使用される。マイクロ波プラズマの高い周波数は、効率的なエネルギー伝達と処理物の加熱を可能にする。
一方、RFプラズマはマイクロ波プラズマに比べて低い周波数で作動する。DC（直流）プラズマと同じ成膜速度を得るためには、1,012ボルト以上の高い電圧が必要である。RFプラズマでは、電波を使ってガス原子の外殻から電子を取り除くが、DCプラズマではガスプラズマ原子に直接電子をぶつける。RFプラズマでは電波を発生させるため、DCプラズマの電子電流と同じ効果を得るには、より多くの電力を投入する必要がある。
さらに、RFプラズマは、DCプラズマに必要な100mTorrに比べ、15mTorr以下という大幅に低いチャンバー圧力で維持することができる。この低圧により、荷電プラズマ粒子とターゲット材料との衝突が少なくなり、粒子が基材上にスパッタされる経路がより直接的に形成される。RFプラズマは、絶縁性を持つターゲット材料に特に適している。
実用的な利点という点では、13.56MHzで作動する高周波（RF）システムなどのRFプラズマ・システムは、電極の交換が不要なため、メンテナンスの手間なく長時間運転が可能である。また、導電性と絶縁性の両方のターゲット材料に対応する。
要約すると、RFプラズマとマイクロ波プラズマの主な違いは、その周波数、必要電圧、チャンバー圧力、異なるタイプのターゲット材料に対応する能力にある。マイクロ波プラズマは、高周波電磁放射を特徴とし、炭素材料の合成に使用される。RFプラズマは、より低い周波数で動作し、より高い電圧を必要とし、より低いチャンバー圧力で維持できるため、絶縁性のターゲット材料のスパッタリングに適しています。
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