RNAの安定性は温度依存性が高く、分解速度は保存条件によって大きく異なる。RNAは超低温(-20℃~-80℃)では長期間安定であるが、高温、特に4℃以上ではその完全性は徐々に低下する。室温での短期保存は可能であるが、冷蔵や冷凍保存に比べ劣化リスクが高い。
キーポイントの説明
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超低温保存(-20℃~-80)
- RNAは-20℃または-80℃で保存すると、数ヶ月から数年間安定した状態を保つ。
- 凍結融解サイクルを繰り返しても(最大10回)、RNAは著しく劣化しないため、これらの温度は長期保存に理想的である。
- しかし、霜のない冷凍庫は、温度変動により安定性が損なわれる可能性があるため、避けるべきである。
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冷蔵保存 (4°C)
- RNAは4℃で14日間まで保存でき、大きな劣化はない。
- 保存バッファーが時間とともに蒸発する可能性があるため、チューブをしっかりと密封することを推奨する。
- 短期間の実験には適しているが、長期保存には不向きである。
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室温(20-25)
- RNAは室温で約48時間安定であるが、これを超えると分解リスクが高まる。
- RNアーゼの混入や紫外線への暴露は分解を促進する可能性があるため、取り扱い上の注意が重要である。
- 保存よりも即時処理に使用するのが最適である。
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RNAの安定性に影響する重要な因子
- RNアーゼの混入:微量のRNaseでもRNAを急速に分解するため、RNaseフリーのチューブや試薬を使用することが重要である。
- バッファー組成:RNase阻害バッファー(TEバッファーや市販のRNA安定化溶液など)で保存すると安定性が向上する。
- サンプル濃度:希薄なRNAは分解が速く、濃縮されたサンプルは回復力が高い。
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購入者への実践的推奨事項
- 優先順位 RNaseフリーの消耗品 (チューブ、チップ)を使用し、コンタミネーションリスクを最小限に抑えます。
- 超低温フリーザーのないラボ向け、 RNA安定化試薬 (例:RNA late)は、室温での安定性を延長することができる。
- 考察 凍結乾燥RNA は、液体サンプルよりも劣化しにくいため、常温保存が必要なアプリケーションに適している。
これらの温度依存性安定性プロファイルを理解することにより、研究者や購入者は、サンプルの完全性を確保するためのRNA取り扱い、保管機器、消耗品について、十分な情報に基づいた決定を行うことができる。
まとめ表
保管温度 | 安定期間 | 主な考慮事項 |
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-20℃〜-80 | 数ヶ月~数年 | 凍結融解を何度も繰り返しても安定。 |
4℃(冷蔵) | 最長14日間 | 緩衝液の蒸発を防ぐため、チューブを密栓する。 |
室温(20~25) | ~48時間 | 分解リスクが高い;RNaseフリーのハンドリングを使用する。 |
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