オートクレーブの100℃以上の温度は、圧力と必要な滅菌時間に応じて、通常121℃または134℃に設定される。108キロパスカル（kPa）の場合、温度は121℃、滅菌時間は20分。206kPaの場合、温度は134℃で、滅菌はわずか10分で達成される。
説明
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温度と圧力の関係： オートクレーブは高圧の蒸気を使い、通常の水の沸点（100℃）以上の温度を実現する。圧力が高まることで蒸気が高温に達し、微生物を効果的に死滅させる能力が高まる。この圧力と温度の関係は、滅菌プロセスの効率にとって極めて重要である。
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滅菌時間： オートクレーブでの滅菌時間は温度と圧力に反比例する。高い温度（206kPaで134℃など）は、低い温度（108kPaで121℃）より長い時間（20分）を要するのに比べ、滅菌に要する時間は短い（10分）。これは、高温の方が微生物に対する致死性が高いため、短時間で滅菌できるためである。
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材料の適合性： オートクレーブ滅菌で使用される高温・高圧に、すべての素材が耐えられるわけではないことに注意することが重要である。したがって、オートクレーブに入れる物品が、この温度での蒸気滅菌に適合していることを確認することが不可欠である。
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オートクレーブの限界 オートクレーブ滅菌はほとんどの微生物に対して非常に有効であるが、プリオンや一部の細菌毒素のような特定の耐性病原体に対しては、追加的または代替的な滅菌方法が必要となる場合がある。例えば、プリオンは水酸化ナトリウム（1N NaOH）で処理し、121℃で30分間加熱した後、通常の滅菌を行う必要がある。
要約すると、オートクレーブは100℃以上の温度、一般的には121℃または134℃で操作され、機器や材料を効果的に滅菌する。どの温度を選択するかは、滅菌される材料と存在する微生物の耐性に特有の要件に依存する。
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