バイオマスエネルギーは、主に大規模に利用する場合や、廃棄物を原料として利用する場合に費用対効果が高い。しかし、ガス洗浄やコンディショニングのための投資コストが高い、エネルギー密度が低い、プラント建設に大きなスペースが必要、といった課題が、特に小規模の場合、総合的な費用対効果に影響を与える。
大規模操業と廃棄物利用：
バイオマスエネルギー技術、特にバイオマス燃焼技術は商業的に利用可能であり、投資家にとってリスクは最小である。廃棄物を原料として使用すれば、経済的な競争力を持つ。数百MWから数千MWの大規模事業では、石油産業から転用されることの多い関連設備の有効性により、経済的持続可能性が達成される。小規模事業における課題：
バイオマスガス化の場合、小規模で費用対効果を達成することは、化石ベースのプロセスと比べて困難である。ガスの洗浄と調整に関連する高いコストは、投資コストに40％以上の影響を与える可能性がある。さらに、この技術にはバイオマス由来の合成ガスに特化した適応が必要であり、ガス化の柔軟性とプロセス集約化を改善するためのさらなる研究開発（R&D）が必要である。
エネルギー密度と必要スペース
バイオマスは化石燃料に比べてエネルギー密度が低く、その一因は水分を多く含むため、変換時にエネルギー損失が生じることである。また、バイオマス・プラントの建設には大きなスペースが必要であるため、土地代が高く、生産性が制限される可能性のある都市部では、そのような施設を設置することが難しい。研究開発の必要性
バイオマスエネルギーの費用対効果を高めるための研究開発活動が強く求められている。これには、原料コストを安定させるための農業慣行の改善や育種努力、バイオマス由来の合成ガスに特化したソリューションの開発などが含まれる。このような進歩により、バイオマスエネルギーは、短いサプライチェーンに依存する分散型生産モデルとの整合性を高めることができる。
