実験室での一般的な滅菌方法には、蒸気滅菌（オートクレーブ使用）、乾熱滅菌（電子レンジやオーブン使用）、放射線滅菌、ガス滅菌（エチレンオキシドなど）、ろ過滅菌、蒸気滅菌、液体滅菌などがある。各方法には特定の用途や条件があり、それぞれ異なる種類の材料や環境に適している。
蒸気滅菌（オートクレーブ）：
蒸気滅菌は、その効果、スピード、コストの低さから、最も広く使用されている方法である。加圧下で飽和蒸気の形で湿熱を利用し、微生物を死滅させる。このプロセスには、蒸気、圧力、温度、時間という4つの重要なパラメーターが関係する。一般的に使用される温度は、121℃（250°F）で30分間、または132℃（270°F）で4分間である。この方法は、実験器具、生物学的廃棄物、高温と湿気に耐えられる材料に最適である。乾熱滅菌：
蒸気滅菌とは異なり、乾熱滅菌は湿気のない状態で高温を利用するもので、オーブンや電子レンジを利用するのが一般的である。この方法は、粉体や油のような水分によって損傷を受ける可能性のある材料に効果的である。効果的な滅菌に必要な高温（通常160℃以上、少なくとも2時間）により、すべての微生物が確実に破壊される。
放射線滅菌：
ガンマ線や電子線などの電離放射線を用いて微生物を死滅させる方法。高温や湿気に耐えられない医療機器や医薬品に特に有効である。このプロセスは非常に効果的ですが、放射線の危険な性質のため、特殊な設備と安全対策が必要です。ガス滅菌（酸化エチレン）：
エチレンオキサイド滅菌は、ガスを用いて微生物を死滅させる化学的プロセスである。熱に弱く、湿気に弱い素材に効果的である。このプロセスでは、安全性と有効性を確保するために、温度、湿度、ガス濃度を注意深く管理する必要がある。酸化エチレンは反応性が高く、包装材料に浸透するため、複雑な医療機器に適している。
ろ過による滅菌：
この方法は、微生物を捕捉するのに十分な小さな孔を持つフィルターに液体または気体を通過させるものである。抗生物質やワクチンなど、熱に弱い液体の滅菌によく用いられる。この方法の有効性は、フィルターの品質と完全性に左右される。
